圖像處理與分析平台由三台蔡司共聚焦顯微鏡和兩台萊卡熒光顯微鏡組成，其具體構成和參數配置如下。

   蔡司共聚焦顯微鏡分别為：激光共聚焦顯微鏡LSM510，配置488nm、543nm、633nm激光；激光共聚焦顯微鏡LSM700，配置405nm、488nm、555nm、639nm激光；雙光子共聚焦顯微鏡LSM710，配置單光子激光405nm、488nm、561nm、633nm，雙光子激光680—1064nm。共聚焦顯微鏡可用于觀察各種染色、非染色熒光标記的組織、細胞等，包括細胞組織結構的精确描述、定位，離子通道的直觀觀察和變化的動态記錄。此外，LSM710可用于活體檢測，雙光子光源波長較長，穿透力強，可觀察更深層次的組織結構。

   兩台萊卡熒光顯微鏡分别為正置顯微鏡DM5000B，主要用于組織切片觀察，倒置顯微鏡DM3000B，主要用于活細胞觀察。