陳磊 教授，博士生導師
E-mail: leichen@seu.edu.cn
辦公室地點：南京市四牌樓2号，bet356在线官方网站五五樓312室
實驗室地點：南京市四牌樓2号，bet356在线官方网站五五樓301室
個人簡介
陳磊博士的主要研究方向為腸道穩态調控的新機制。博士期間主要研究腸道菌群對腫瘤發生與治療的影響，建立了腸道菌群與藥物作用機制的研究平台，并于2014年在香港浸會大學獲得博士學位。2015年底，赴美國Rutgers University從事博士後研究，将研究領域拓展至腸道宿主細胞的調控，從而實現了自身研究背景中的藥物-腸道菌群-宿主細胞調控的領域連接。國家級人才獲得者，于2022年受聘為bet356在线官方网站教授，并入選bet356在线官方网站青年首席教授。
代表研究工作包括建立了BMP信号通路調控腸道細胞分化的新機制，發現了決定腸吸收細胞系命運的關鍵因子；揭示了腸道幹細胞更新中的重要代謝調控新機制；發現了影響腸道發育的關鍵轉錄因子調控網絡等。以第一作者或通訊作者在Nature Genetics、Gastroenterology、Nature Communications等國際著名學術期刊上發表文章15篇；并以共同作者在Genes & Development、PNAS、Cancer Research等發表文章10篇；因發現轉錄因子HNF4與抑癌基因在腸道的前饋調控獲得Gallo Award for Outstanding Cancer Research。陳磊博士有着豐富的項目主持與參與經驗，主持了美國新澤西州癌症研究委員會資助項目，參與了美國國立衛生研究院R01科研項目3項、香港研究資助局項目1項、澳門科學技術發展基金委研究項目1項以及江蘇省高校自然科學研究重大項目、江蘇省自然科學基金等3項。
研究方向
小腸是人體最主要的消化吸收器官，而腸上皮細胞又是成人體内更新最快的一類細胞。腸道幹細胞分化為具有增殖功能的腸上皮隐窩細胞，隐窩細胞向絨毛不斷遷移，并進一步分化為小腸絨毛細胞。腸道幹細胞是腸道損傷再生、腸癌等多種腸道疾病研究的焦點。課題組旨在建立類器官 (臨床科研一體化)、藥物-腸菌-宿主細胞 (新藥研發産業化) 和表觀遺傳學 (前沿基礎科學研究) 的科研平台，結合生物信息學、小鼠遺傳學、表觀遺傳學、代謝組學、類器官體外培養和宏基因組學等，探索腸道穩态調控的新機制，發現腸紊亂疾病治療的新靶點。
近期代表性論文
[1] Chen L., Toke N.H., Luo S., Vasoya R.P., Fullem R.L., Parthasarathy A., Perekatt A.O., Verzi M.P., A reinforcing HNF4-SMAD4 feed-forward module stabilizes enterocyte identity. Nature Genetics, 2019, 51(5):777-785
[2] Chen L., Vasoya R.P., Toke N.H., Parthasarathy A., Luo S., Chiles E., Flores J., Gao N., Bonder E.M., Su X.Y., Verzi M.P., HNF4 regulates fatty acid oxidation and is required for renewal of intestinal stem cells in mice. Gastroenterology, 2020, 158(4):985-999
[3] Chen L.*, Luo S., Dupre A., Vasoya R.P., Parthasarathy A., Aita R., Malhotra R., Hur J., Toke N.H., Chiles E., Yang M., Cao W., Flores J., Ellison C.E., Gao N., Sahota A., Su X.Y., Bonder E.M., Verzi M.P.*, The nuclear receptor HNF4 drives a brush border gene program conserved across murine intestine, kidney, and embryonic yolk sac. Nature Communications, 2021, 12(1):2886 (*通訊作者)
[4] Chen L., Cao W., Aita R., Aldea D., Flores J., Gao N., Bonder E.M., Ellison C.E., Verzi M.P., Three-dimensional interactions between enhancers and promoters during intestinal differentiation depend upon HNF4. Cell Reports, 2021, 34(4):108679
[5] Chen L.*, Marishta A., Ellison C.E., Verzi M.P.*, Identification of Transcription Factors Regulating SARS-CoV-2 Entry Genes in the Intestine. Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, 2021; 11(1): 181-184 (*通訊作者)
[6] Wang Y.*, Chen L.*, Lung tissue distribution of drugs as a key factor for COVID-19 treatment. British Journal of Pharmacology, 2020, 177(21):4995-4996 (*通訊作者)
[7] Chen L., Toke N.H., Luo S., Vasoya R.P., Aita R., Parthasarathy A., Tsai Y.H., Spence J.R., Verzi M.P., HNF4 factors control chromatin accessibility and are redundantly required for maturation of the fetal intestine. Development, 2019, 146(19). pii: dev179432 (封面文章)
[8] Kumar N1, Tsai Y.H.1, Chen L.1, Zhou A.B., Banerjee K.J., Saxena M., Huang S., Toke N.H., Xing J.C., Shivdasani R.A., Spence J.R., Verzi M.P., The lineage-specific transcription factor CDX2 navigates dynamic chromatin to control distinct stages of intestine development. Development, 2019, 1;146(5). pii: dev172189 (1共同第一作者)
[9] Yang Y., Gomez M., Marsh T., Poillet-Perez L., Sawant A., Chen L., Park N.R., Jackson S.R., Hu Z., Alon N., Liu C., Debnath J., Guan J.L., Davidson S., Verzi M., White E. Autophagy in PDGFRα+ mesenchymal cells is essential for intestinal stem cell survival. Proc Natl Acad Sci U S A, 2022，24;119(21):e2202016119
[10] Banerjee K.K., Saxena M., Kumar N., Chen L., Cavazza A., Toke N.H., O'Neill N.K., Madha S., Jadhav U., Verzi M.P., Shivdasani R.A., Enhancer, transcriptional, and cell fate plasticity precedes intestinal determination during endoderm development. Genes & Development, 2018, 32(21-22):1430-42
[11] Perekatt A.O., Shah P.P., Cheung S., Jariwala N., Wu A., Gandhi V., Kumar N., Feng Q., Patel N., Chen L., Joshi S., Zhou A., Taketo MM.., Xing J., White E., Gao N., Gatza M.L., Verzi M.P., SMAD4 suppresses WNT-driven de-differentiation and oncogenesis in the differentiated gut epithelium. Cancer Research, 2018, 78(17):4878-90
完整發表文章列表https://orcid.org/0000-0001-7812-508X
