孫飛     教 授 博士生導師

E-mail: fsun@seu.edu.cn

辦公地點:南京市四牌樓2号,五五樓342




個人簡介:

2009年畢業于山東大學生命科學學院,獲學士學位;2014年畢業于中國科學院微生物研究所,獲博士學位;2014-2021年在美國加州大學洛杉矶分校(UCLA)擔任博士後研究員和助理項目科學家;2022年加入bet356在线官方网站,任上崗研究員(教師系列,正高職稱)。

 

研究方向:三維基因組與基因調控

Hi-C為代表的染色體構象捕獲技術的發展使人們對基因組的認識進入了3D水平。利用三維基因組技術重建的染色質互作圖譜顯示,染色體在不同層次上形成各式各樣的三維結構。這些結構的紊亂雖然不會直接造成基因缺陷,但會使基因的表達産生異常并可能導緻癌症等一系列疾病的發生。本課題組以小鼠胚胎幹細胞或癌細胞為模式生物,利用多組學手段,結合生物信息學,深入研究染色體三維結構的功能和轉錄調控的機理,具體研究内容包括:(1)三維基因組與轉錄調控和緻癌突變之間的相互關系;(2)反式作用因子(如RNA聚合酶及各種轉錄因子)在基因調控和癌症發生過程中的功能;(3)新型組學方法和生物信息學分析工具的開發。

 

代表性論文:

1. Sun F, Sun T, Kronenberg M, Tan X, Huang C, Carey MF. (2021) The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator binding but not promoter-enhancer looping. Genes & Development, 35(15-16): 1175-1189.

2. Sun F, Chronis C, Kronenberg M, Chen XF, Su T, Lay FD, Plath K, Kurdistani S, Carey MF. (2019) Promoter-enhancer communication occurs primarily within insulated neighborhoods. Molecular Cell, 73(2): 250-263.

3. Xue Y#, Pradhan S#, Sun F#, Chronis K, Tran N, Van C, Vashisht A, Wohlschlegel J, Peterson CL, Timmers HTM, Kurdistani SK, Carey MF. (2017) Mot1, Ino80C and NC2 function coordinately to regulate pervasive transcription in yeast and mammals. Molecular Cell, 67(4): 594-607. (#并列第一作者)

4. Sun F, Huang L. (2016) A euryarchaeal histone modulates strand displacement synthesis by replicative DNA polymerases. Science China Life Sciences, 59(7): 709-716.

5. Sun F, Huang L. (2013) Sulfolobus chromatin proteins modulate strand displacement by DNA Polymerase B1. Nucleic Acids Research, 41(17): 8182-95.


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