馮思謙 教授 博士生導師
Email: siqian_feng@yahoo.com
辦公地點：南京市四牌樓2号，微波樓109室
2004年獲得上海交通大學生物工程學士學位，2011年獲得美國馬裡蘭大學College Park分校分子細胞生物學博士學位。從2012年7月起在美國哥倫比亞大學從事研究工作，先後擔任博士後研究員以及副研究科學家（Associate Research Scientist）。2023年8月加入bet356在线官方网站，擔任研究員（正高級職稱），并獲聘江蘇省特聘教授。
研究方向：轉錄調控的分子機制，以及轉錄在發育和進化過程中的作用
方向1：每個細胞都必須精确調控它們的基因表達，而轉錄被普遍認為是基因表達過程中最重要的調控節點。本課題組以果蠅Hox家族轉錄因子為模型，融合前沿的全基因組系統生物學，以及經典的分子遺傳和發育生物學等手段，揭示細胞特異性轉錄調控的詳細分子機理。
方向2：在漫長進化過程中，全新身體結構時常出現，例如哺乳動物的胎盤以及昆蟲的翅。此類全新結構往往賦予物種極大生存優勢。全新身體結構最初如何進化出來，是目前進化發育（EvoDevo）領域最重要的未解之謎之一。目前證據指向轉錄調控在這一過程中作用重大。本課題組以昆蟲的翅為模型，充分利用在轉錄領域的專長，探索全新身體結構如何從無到有進化出來。
方向3：新技術對于科學研究的促進作用不言而喻，本課題組緻力于開發新的基因組學和分子生物學技術以達成現有方法難以實現的研究目标。課題組最近利用SpyTag和SpyCatcher之間的蛋白質共價相互作用，成功獲取細胞特異性蛋白-DNA結合數據。今後，課題組将繼續利用蛋白共價相互作用實現對于體内組織的多維度細胞特異性表征。
近期代表作：
Siqian Feng# and Richard. S Mann#. Scarless modification of the Drosophila genome near any mapped attP sites. Current Protocols. 3(8):e855 (2023). #兼通訊作者
Siqian Feng, Chaitanya Rastogi, Ryan E. Loker, William J. Glassford, H. Tomas Rube, Harmen J. Bussemaker, and Richard S. Mann. Transcription factor paralogs orchestrate alternative gene regulatory networks by context-dependent cooperation with multiple cofactors. Nature Communications. 13(1):3808 (2022).
Siqian Feng# and Richard S. Mann#. SpyChIP identifies cell type-specific transcription factor occupancy from complex tissues. PNAS, 119(25): e2122900119 (2022).#兼通訊作者
H. Tomas Rube, Chaitanya Rastogi, Siqian Feng, Judith F. Kribelbauer, Allyson Li, Basheer Becerra, Lucas A. N. Melo, Bach Viet Do, Xiaoting Li, Hammaad H. Adam, Neel H. Shah, Richard S. Mann, and Harmen J. Bussemaker. Probing molecular specificity with deep sequencing and biophysically interpretable machine learning. Nature Biotechnology. 40(10):1520-1527 (2022).
Siqian Feng#, Shan Lu, Wesley B. Grueber and Richard S. Mann#. Scarless engineering of the Drosophila genome near any site-specific integration site. Genetics. 217(3), iyab012 (2021). #兼通訊作者。
Judith F. Kribelbauer, Ryan E. Loker, Siqian Feng, Chaitanya Rastogi, Namiko Abe, H. Tomas Rube, Harmen J. Bussemaker and Richard S. Mann. Context-Dependent Gene Regulation by Homeodomain Transcription Factor Complexes Revealed by Shape-Readout Deficient Proteins. Molecular Cell. 78(1):152-167.e11 (2020).
Siqian Feng, Steffi Thomas and Jian Wang. Diverse tumor pathology due to distinctive patterns of JAK/STAT pathway activation caused by different Drosophila polyhomeotic alleles. Genetics. 190(1):279-82 (2012).
Siqian Feng*, Jianhua Huang* and Jian Wang. Loss of the Polycomb group gene polyhomeotic induces non-autonomous cell proliferation. EMBO Reports. 12(2):157-63 (2011).
